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MateriApps LIVE! による物質科学シミュレーション - チュートリアル資料

このページでは、Web上で公開されている物質科学シミュレーションのチュートリアル資料をまとめています。これらのチュートリアルは全て、MateriApps LIVE!で実行することができます。

MateriApps LIVE!講習会 (2020-04-23/05-14/06-18/08-06)

OnlineTutorial Web講習会(オンラインチュートリアル)のための準備
Tutorial202004

MateriApps LIVE!講習会 (2019-11-07@柏の葉キャンパス)

講習会資料
- 講習会について
  - 資料0: 「MateriApps LIVE!講習会」 tutorial.pdf
- MateriApps LIVE!の概要・インストール
  - 資料1: 「MateriApps LIVE!の設定」
  - 資料2: 「MateriApps LIVE! / はじめの一歩」
- ALPS、HΦ、mVMCの概要
  - 資料3: 「ALPSチュートリアル 03 - アプリケーション実習(1)」 03_tutorial1.pdf
  - 資料4: 「HPhiの概要」 ITO-Handson-yamaji.pdf
  - 資料5: 「mVMCの概要」 17_Aug_mVMC_HandsOn.pdf
- ALPS実習
- HΦ実習
  - 資料10: 「高性能汎用格子模型ソルバーHΦ 利用の手引き」 userguide_jp.pdf 3章「チュートリアル」
- mVMC実習
  - 資料11: 「mVMCの演習問題」 mVMC_problem.pdf
- MateriApps LIVE! レビュー記事 @ MateriApps
  - 第一原理計算
    - Quantum ESPRESSO - 擬ポテンシャル法と平面波基底を用いた第一原理計算ライブラリ
    - OpenMX - 原子局在基底と擬ポテンシャルを用いた第一原理計算プログラム
      - OpenMX の MateriApps LIVE! での体験記
    - xTAPP - 擬ポテンシャル法と平面波基底を用いた第一原理計算ライブラリ
      - xTAPP の MateriApps LIVE! での体験記
  - 分子動力学計算
    - LAMMPS - オープンソースの汎用古典分子動力学アプリケーション
      - LAMMPS の MateriApps LIVE! での体験記
  - 格子模型
    - ALPS - 磁性体や相互作用電子系などの強相関格子模型を取り扱う数値計算ライブラリ
      - ALPSを使ったDMRGの計算例
      - ALPSを使ったQMC計算例
    - DSQSS - 格子上で定義された量子多体系の計算プログラム
      - DSQSSで一次元ハイゼンベルク模型の帯磁率・動的感受率を計算してみる
    - HΦ - 並列計算機に対応した数値厳密対角化法による有効模型ソルバーパッケージ
    - Kwant - 量子伝導特性の計算を行うオープンソースのPythonパッケージ
      - https://ma.issp.u-tokyo.ac.jp/app-post/1185?appid=589
  - データ科学・機械学習
    - scikit-learn - データマイニング・データ解析のためのオープンソース計算ライブラリ
      - MateriApps LIVE!とscikit-learnによるマテリアルズインフォマティクスチュートリアル
    - COMBO - 機械学習で使われるベイズ最適化のPythonライブラリ
      - MateriApps LIVE! と COMBO によるベイズ最適化
  - 可視化
    - VESTA - Windows, Linux, Mac OS Xで動作する結晶構造ならびにグリッドデータの可視化ソフト
      - VESTAの利用例

イントロダクション/準備

MateriAppsとMateriApps LIVE!の概要/MateriApps LIVE!の設定 (PDF)
MateriApps LIVE! VirtualBox版の起動方法 (web)
物質科学計算パッケージソフトMateriApps LIVE! 講習会(2015-09-02) 第1部 (ビデオ)

第一原理計算手法によるバンド計算

[AkaiKKR] AkaiKKRでバンド構造(分散関係) (web)
[OpenMX] MateriApps: OpenMXを利用した第一原理計算の簡単な実習(2017-10-03) (PDF)
[OpenMX] MateriApps LIVE!を用いた計算物質科学＠材料構造の解析に役立つ計算科学研究会(2015-07-28) (PDF)
[OpenMX] OpenMX の MateriApps LIVE! での体験記 (MateriAppsレビュー記事)
[Quantum ESPRESSO] quantum ESPRESSO tutorial (web)
[Quantum ESPRESSO] Quantum ESPRESSO の MateriApps LIVE! での examples の実行例 (MateriAppsレビュー記事)
[Quantum ESPRESSO] Quantum EspressoでSiのフォノンバンド図を作成する (MateriAppsレビュー記事)
[xTAPP] xTAPP の MateriApps LIVE! での体験記 (MateriAppsレビュー記事)

格子模型計算

[ALPS] ALPS Tutorial (2017-07-20) (PDF)
[ALPS] 物質科学計算パッケージソフトMateriApps LIVE! 講習会(2015-09-02) 第3部 (ビデオ)
[ALPS] 物質科学計算パッケージソフトMateriApps LIVE! 講習会(2015-09-02) 第3部 (PDF)
[HPhi] HPhi講習会＠東大物性研 (2017-06-29) (web)
[mVMC] Tutorial for mVMC (2017-08-30) (web)

分子動力学法による溶液のシミュレーション

[Gromacs] 物質科学計算パッケージソフトMateriApps LIVE! 講習会(2015-09-02) 第2部 (ビデオ)
[Gromacs] 物質科学計算パッケージソフトMateriApps LIVE! 講習会(2015-09-02) 第2部 (PDF)
[LAMMPS] 第1回LAMMPS初心者向け講習会 (2017-11-21) (PDF)
[LAMMPS] LAMMPS の MateriApps LIVE! での体験記 (MateriAppsレビュー記事)

量子化学計算

(募集中)

その他

[Kwant] Kwantの実行例(MateriApps LIVE!) (MateriAppsレビュー記事)
Tutorial201907