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LAB1
- Pipetas P200, P20 e P10
- Pontas amarelas, azuis e brancas estéreis, NOVOS
- Eppendorfs 1.5 mL NOVOS
- Marcadores
- 4 caixas de esferovite para gelo
- 4 tubos Eppendorf 2 mL com 1.8-2.0 mL tampão P1 (marcados "P1")
- 4 tubos Eppendorf 2 mL com 1.8-2.0 mL tampão P2 (marcados "P2")
- 4 tubos Eppendorf 2 mL com 1.8-2.0 mL tampão P3 (marcados "**P3")
- 4 tubos Falcon 50 mL com ~20 mL etanol seco 99% (qualidade pura para DNA, marcados EtOH 99%)
- 4 tubos Falcon 50 mL com ~20 mL etanol 70% (qualidade pura para DNA, marcados EtOH 70%)
- 4 tubos Falcon 50 mL com ~20 mL Agua ultrapura estéril (4 tubos no total, marcados ddH2O)
- 4 tubos Eppendorf com 1 mL tampão 1x TE (4 tubos no total, marcados 1xTE)
- Suportes para Tubos Eppendorf
- Microcentrifuga para tubos Eppendorf
Não é necessário preparar P1, P2 ou P3 de novo. Temos no LGM.
LAB2
PCR template for | Template | Primer1 | Primer2 |
---|---|---|---|
amp | pBR322 | 1113 | 987 |
pBR | pBR322 | 1196 | 1195 |
2µ | YEplac195 | 984 | 983 |
LEU2d | YIplac128 | 982 | 979 |
ΔCRP | pYPKpw | 978 | 977 |
-
PCR primers (5 µM) (see table above) volume >= 30 µL
-
1.66 x colored PCR mastermix = 20 students * 25 µL 2xPCR mastermix * 1.2 + 20 * 8 µL 6x DNA loading buffer * 1.2 = 792 µL (33 µL for each 50 µL PCR reaction)
-
6x DNA loading buffer ✅
-
DNA ladder✅
-
1 tina de eletroforese (Bachman, LGM) ✅
-
Fonte de eletricidade ✅
-
4 placas Petri quadrados
-
Barquinhos de pesagem (plástico, LGM)✅
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Pontas amarelas, azuis e brancas estéreis, NOVOS
-
Eppendorfs 1.5 mL NOVOS
-
Tubos Falcon 50 mL (NOVOS, 1 saco)
-
Tubos PCR
-
4 suportes para tubos Eppendorf
-
4 suportes para tubos PCR
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Microcentrifuga para tubos Eppendorf
-
200 mL Agua ultrapura estéril num Schott 250 mL
-
1 provetas 100 mL
-
4 Erlenmeyers 100 mL
-
4 Schotts 100 - 250 mL
-
Agar
-
Peptone ou Tryptone
-
Glucose
LAB3
- 25 mL YPD culture with CENPK111-32D MATa URA3 HIS3 leu2-3,112 TRP1 MAL2-8c SUC2 (µ880) ✅ LGM
- ~5-10 mL YPD for spectrophotometer✅ LGM
- cuvettes usados
- 4 Erlenmeyer estereis 250 - 500 mL com algodão
- 4 Schotts 500 mL com tampa, não estereis
- Yeast Nitrogen Base (YNB) WITHOUT AMINO ACIDS
- Agar
- Glucose
- Agarose para geis (>4 g)
- Tampão TAE x 1
- Tampão stock TAE x 50
- 1 proveta 1L (plastico)
- 1 copo 2L (plastico)
LAB4
-
banho maria 42°C
-
4 barcos para tubos eppendorf
-
Schott com 1/2 L agua ultrapura autoclavado
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1 saco com tubos FALCON 50 mL novos, estéreis
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PLS 300 µL x 16 = 5 mL ✅ LGM
-
1 tubo FALCON com ~10-20 mL de esferas de vidro (~5 mm) estéreis ✅ LGM
-
YPD medium ~30 mL ✅
-
Tubos Eppendorf novos
-
Pontas azuis, amarelas estéreis
-
suportes para tubos eppendorf
-
suportes para tubos FALCON 50 mL
-
microcentrífuga
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Pipetas P1000, P200, P20
-
4 caixas de esferovite
Preparation of an agarose gel (one for all groups)
- The four groups should make one 350 mL 0.8 % w/v agarose gel in 1 x TAE buffer together.
- Use the balance to weigh agarose in a small plastic weighing boat.
- Dilute 1x TAE buffer from the stock (x50) if necessary.
- Add agarose and 300 mL 1 x TAE buffer to an 1 L glass beaker.
- Heat the cup in a microwave oven for 5 x 1 min, stir with a glass pipette in between.
- Check so that the gel appears like water with no suspended particles.
- Wait for the gel to cool down.
- Pour the gel in the gel tray indicated by the teacher.
Make solid medium for transformation on LAB4 (one per group)
Each group should make 300 mL solid [SD]] medium in a 500 mL [Schott flask.
- 6.7 g/L Yeast Nitrogen Base (YNB) WITHOUT AMINOACIDS
- 20 g/L glucose
- 20 g/L Agar for solid medium
- Put approx 100 mL dH2O in a 500 mL Schott flask
- Weigh all ingredients in plastic weighing boats (ingredients are dry powders).
- Add the ingredients to the flask and mix.
- Top up with water to 300 mL
- 20 placas de Petri vazios (1 pacote)
LAB5
mastermix (LGM)✅:
- 20 * 20 = 400 µL 2xmastermix
- 20 * 2 µL = 40 µL 1222 (10 µM)
- 20 * 2 µL = 40 µL 1779 (10 µM)
- 4 mL 20 mM NaOH in four Eppendorf tubes
- 95°C heat block or water boiler
- 4~5 mL TE buffer
- PCR tubes
- Eppendorf tubes (New)
- blue, yellow tips
LAB6
- Agarose gel ~20 wells
- 6x DNA loading buffer
- Tryptone or Peptone
- Yeast extract
- NaCl
- Agar
- Eppendorf tubes 2 mL (New)
- blue, yellow tips
- 4x Schott bottles (500 mL) w lid
LAB7
- Liquid LB medium
- 4 x Eppendorf tubes, 2 mL
- Eppendorf tubes 1.5 mL
- Blue, yellow tips
- P1000, P200, P20 pipettes
- Water bath 37°C
- Glass beads, 5 mm
- LB-amp plates
LAB8
- Pipetas P200, P20 e P10
- Pontas amarelas, azuis e brancas estéreis, NOVOS
- Eppendorfs 1.5 mL NOVOS
- Marcadores
- 4 caixas de esferovite para gelo
- 4 tubos Eppendorf 2 mL com 1.8-2.0 mL tampão P1 (marcados "P1")
- 4 tubos Eppendorf 2 mL com 1.8-2.0 mL tampão P2 (marcados "P2")
- 4 tubos Eppendorf 2 mL com 1.8-2.0 mL tampão P3 (marcados "**P3")
- 4 tubos Falcon 50 mL com ~20 mL etanol seco 99% (qualidade pura para DNA, marcados EtOH 99%)
- 4 tubos Falcon 50 mL com ~20 mL etanol 70% (qualidade pura para DNA, marcados EtOH 70%)
- 4 tubos Falcon 50 mL com ~20 mL Agua ultrapura estéril (4 tubos no total, marcados ddH2O)
- 4 tubos Eppendorf com 1 mL tampão 1x TE (4 tubos no total, marcados 1xTE)
- Suportes para Tubos Eppendorf (4 grupos)
- Microcentrifuga para tubos Eppendorf
Não é necessário preparar P1, P2 ou P3 de novo. Temos no LGM.
- 5 mL Liquid LB medium in a 15 mL FALCON tube
LAB9
restriction digestion, gel electrophoresis