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NIBB GITC 2025 春 RNA-seq入門

基礎生物学研究所 ゲノムインフォマティクス・トレーニングコース 2025年3月 RNA-seq入門

「RNA-seq入門 : RNA-seq解析パイプライン」

公式HP@NIBB

聴講参加のための環境構築について

宿題

参加者の皆さんは以下の宿題を終わらせてトレーニングコースにのぞんで下さい。

日程

講義資料

(03/05 09:50追記) 0. Introductionの資料をアップロードしました。 (03/03 10:20追記) 2. NGS 基本ツール:IGVで使用するデータを追加しました。 (02/28 13:10追記) 3,4,6の資料をアップロードしました。 (02/28 09:00追記) 0,3,4,6を除く資料をアップロードしました。残り資料については現在調整中です。

カラー版PDF(正常に表示されない場合はダウンロードしてご覧ください)

講義資料、サンプルデータおよびZoomでの講義動画についての注意事項

  • 使用する講義資料、サンプルデータおよび講義動画の著作権は基礎生物学研究所に帰属します。引用等のお問い合わせは重信教授まで ([email protected]) The copyright of the lecture materials belongs to the National Institute for Basic Biology, Japan.Unauthorized reproduction or commercial use is prohibited.For inquiries such as quotations, please contact Professor Shigenobu ([email protected]).
  • 使用する講義資料、サンプルデータおよび講義動画は個人的な使用範囲内でお使いいただけますが、営利目的での使用、複製、加工、転載、販売、再配布は一切禁止致します。Lecture materials, sample data and lecture videos to be used can be used within the scope of personal use, but use, duplication, processing, reprinting, sale, and redistribution for commercial purposes are strictly prohibited.
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練習問題・実戦演習

サンプルデータ

よくある質問

Errata

テキストの修正個所が見つかればここに記します。練習問題はwikiを直接修正します。

その他

Tips

アンケート

トレーニングコース終了後、アンケートにご協力ください

参考

NGS解析入門

UNIX 環境の構築に関する資料

Web links

計算科学研究センター

NGS Informatics

R

Programing

Gene Ontology

NGS Informatics (Obsolete)

参考図書

自習の参考に。

新Linux/UNIX入門 改訂(ソフトバンククリエイティブ) 林晴比古 [ISBN: 9784797327427]

バイオサイエンスの統計学―正しく活用するための実践理論(南江堂) 市原清志 [ISBN: 978-4-524-22036-6]

Rの基礎とプログラミング技法(丸善出版) U.リゲス著 石田基広訳 [ISBN: 978-4-621-06131-2]