🦠 Koronawykład #2 (online)

• Zasoby ogólne
• Zasoby danych dot. celów molekularnych

Literatura

• Pubmed: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
• Google scholar: https://scholar.google.pl/

Patenty

• google patents: https://www.google.com/patents

Cele molekularne / choroby

• https://www.targetvalidation.org/ - brings together information on the relationships between potential drug targets and diseases

Sekwencje

• Wstęp
• https://www.uniprot.org/ high-quality and freely accessible resource of protein sequence and functional information.

Szukanie podobnych sekwencji

• BLAST - Basic Local Alignment Search Tool Patrz: wikipedia
• Psi BLAST: Serwer NCBI | Serwer EBI | Serwer MPG
• Smart BLAST: Serwer NCBI
• NCBI BLAST Serwer EBI - to find regions of sequence similarity, which will yield functional and evolutionary clues about the structure and function of your novel sequence.
• HHPRED - Homology detection & structure prediction by HMM-HMM comparison :warning: WOLNE

Alignment

• Dopasowanie sekwencji, uliniowienie sekwencji: wikipedia
• https://www.ebi.ac.uk/Tools/psa/emboss_needle/ - Dwie sekwencje (Pairwise)
• http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/ - Multiple Sequence Alignment

:bulb: Więcej informacji i zasobów

• Bazy danych
• Bazy danych - ćwiczenia