Nature Hallmarks of transcriptional intratumour heterogeneity - zhengxj1/Papers GitHub Wiki

我们整理、注释和整合了来自77个不同研究的数据，以揭示覆盖24种肿瘤类型的1163个肿瘤样本的转录ITH模式。在恶性细胞中，我们确定了41个共识元程序，每个元程序由数十个基因组成，这些基因在许多肿瘤中的细胞亚群中协调上调。元程序涵盖了不同的细胞过程，包括一般的(例如，细胞周期和应激)和谱系特异性模式，我们将其映射为转录ITH的11个标志。大多数癌细胞的元程序与在非恶性上皮细胞中发现的相似，这表明大部分恶性ITH程序甚至在肿瘤发生之前是可变的，反映了其起源细胞的生物学特性。我们进一步将元程序分析扩展到六种常见的非恶性细胞类型，并利用这些来绘制肿瘤微环境中细胞间的相互作用。总之，我们已经组装了一个全面的胰腺癌单细胞rna测序数据集，该数据集可通过Curated Cancer Cell Atlas网站获得，并利用该数据集对转录ITH进行系统表征

癌细胞图谱(3CA;https://weizmann.ac.il/sites/3CA)