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首先分析了CAF中特异性表达的转录因子，PRRX1在CAF中的表达高于在正常组织的成纤维细胞中的表达，并且在来自六个器官的所有六个数据集中，PRRX1表达与成纤维细胞活化评分密切相关。PRRX1的高表达又与肿瘤预后差有关，所以他们就把研究的目标锁定在了PRRX1上
接着，他们在小鼠的成纤维细胞中特异性过表达或敲除PRRX1，并分析表达后对小鼠成瘤的影响。结果发现，成纤维细胞特异性PRRX1表达，会增加免疫功能正常小鼠手术切除后的肿瘤复发：
那么PRRX1是如何诱导CAF的肿瘤促进活性的呢？他们于是分析了PRRX1表达水平高和表达水平低的肿瘤中，他们发现敲低PRRX1后，会导致这些细胞中常见的一组肌成纤维细胞相关基因的表达显着降低，这些基因会影响ECM（细胞外基质）的重塑。通过CAF与肿瘤细胞的成团共培养，然后分离出肿瘤细胞，他们发现，肿瘤细胞和敲除了PRRX1后的CAF共培养后，与对照的肿瘤细胞相比，细胞干性会明显降低：
PRRX1既然是调控了CAF的肌成纤维细胞相关的核心功能，那么PRRX1是不是驱动肌成纤维细胞的mTF（主要转录因子）呢?他们通过三种不同的途径，对潜在的肌成纤维细胞的mTF进行分析，发现PRRX1是八个主要的潜在mTF之一。PRRX1能结合到相关基因的超级增强子结合：
PRRX1在三个代表性的小鼠成纤维细胞中协调肌成纤维细胞程序的mTF，那么PRRX1激活的下游信号通路是啥呢？他们又进行了信号通路的富集，发现TGFβ信号通路会在CAF中激活，且PRRX1缺失后，CAF则无法响应TGFβ信号。于是他们给SMAD和PRRX1进行的共定位（为啥要做SMAD呢？回去翻翻《信号通路是什么鬼？》的TGFβ信号通路那章就会有印象了，SMAD3/4是在TGFβ信号通路中激活下游基因转录的）。结果发现低表达PRRX1后，SMAD3入核量明显减少：
TGFβ信号相关TF（Smad2，Smad3，Smad4和Ap1）的结合序列，经常在Prrx1结合位点附近发现。他们也认为PRRX1能和SMAD3结合（实际上那个coIP图真的很不明显），于是他们假设提出了TGF-β诱导的肌成纤维细胞程序会通过PRRX1-SMAD3复合物激活下游转录。这里要说的是，其实这里证据是不足的。他们在这里使用了PRRX1的突变，但这个突变在Fig. Legend里写了是主要影响PRRX1的表达的突变，并不是PRRX1与SMAD3结合的突变，所以这里的论证是有逻辑缺陷的（其实这里就是肯定后件的逻辑谬误，不知道的话可以看看《列文虎克读文献》或者《信号通路是什么鬼？》看看）。只能说PRRX1对于细胞接受TGFβ信号有关，不能说明是PRRX1通过结合SMAD3复合体起到的作用，因为没有切实可靠的证据。在小鼠中PRRX1是肌成纤维细胞的mTF，于是他们在体外培养的人CAF细胞中进行了超级增强子图谱分析，确定了PRRX1在人肌成纤维细胞亚群也是mTF：
PRRX1是肌成纤维细胞的mTF，于是他们分析了PRRX1对于肌成纤维细胞功能的影响，他们发现PRRX1是体内伤口愈合过程中肌成纤维细胞活化的主要调节因子：
最后他们就把这个和临床应用进行了拓展，就是特异性敲除PRRX1并使用顺铂进行治疗，在成纤维细胞中诱导PRRX1敲除，可以使得免疫功能正常小鼠顺铂耐药癌症的长期缓解：
这篇文章主要做的内容其实概括起来就是发现了PRRX1可以作为CAF中肌成纤维细胞功能的mTF，并且影响肿瘤的发展。