Sample tumor growth - xiaofengleo/phenopackets-rdf-schema GitHub Wiki

Semantic model figure


ShEx

PREFIX : <http://purl.org/ejp-rd/phenopackets-rdf-schema/v010/shex/>
PREFIX obo: <http://purl.obolibrary.org/obo/>
PREFIX sio: <http://semanticscience.org/resource/>

:sampleShape IRI {
  a [obo:NCIT_C43412];
  sio:SIO_000008 @:tumorGradeShape
}
:tumorGradeShape IRI {
  a [sio:SIO_000614];
  sio:SIO_000332 [obo:NCIT_C18000];  
  sio:SIO_000300 [obo:NCIT_C62674]
}

Example turtle

@prefix : <http://purl.org/ejp-rd/phenopackets-rdf-schema/v010/example-rdf/> .
@prefix obo: <http://purl.obolibrary.org/obo/> .
@prefix sio: <http://semanticscience.org/resource/> .



:sample1 a obo:NCIT_C43412;
 sio:SIO_000008  :tumor_grade1 .

:tumor_grade1
    a sio:SIO_000614; # attribute
    sio:SIO_000332 obo:NCIT_C18000; # is about
    sio:SIO_000300 obo:NCIT_C62674 . # has value