1. Перший етап виконання курсової роботи - sophiakravchuk/geneanalysis_project GitHub Wiki

Table of Contents

Опис проблеми, вирішенню якої буде присвячена курсова робота

Оскільки я завжди цікавилася медициною та біологією, то тематикою мого дослідження буде аналіз генетичної інформації різних організмів, а саме схожість певних генів у організмах різного рівня організації.

Генетична інформація — існування в клітинах організмів таких сукупностей генів, які зберігають відомості про послідовність процесів обміну речовин у періоди росту та розмноження, про склад, будову і функції білків та нуклеїнових кислот. Ген — одиниця спадкового матеріалу, що відповідає за формування певної елементарної ознаки [wikipedia].

Генетика зародилася ще у доісторичні часи, люди спостерігали за закономірностями у успадкуванні ознак дітьми від батьків, за розвитком хворіб у цілих родах. Після розшифрування структури ДНК, генетика стала не просто спостереженнями, а доведеною фактами наукою.

За допомогою генетичних даних можна вирішувати багато проблем, таких як:

  • Лікування чи запобігання генетичних хворіб у людей, тварин та рослин;
  • Передбачення генетичних мутацій у ембріонів;
  • Розвиток еволюційної теорії походження людини;
  • Визначення спорідненості організмів;
  • Виведення нових сортів рослин, видів тварин чи штамів бактерій.
Надзвичайно багато вчених і дослідників присвятили своє життя вивченню цієї галузі, і зараз людство має дуже великий пласт генетичної інформації дослідженої і не дослідженої. Зараз є багато ресурсів, які надають цю інформацію. Одним з них є NCBI (The National Center for Biotechnology Information). NCBI - це центр, який вважає своєю місією поширення біотехнологічних знань та заохочення людей до вивчення та дослідження цієї галузі.

Більшість даних NCBI доступні для вільного завантаження, або безпосередньо з сайту FTP NCBI (ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/) або з використанням програмних засобів.

В роботі потрібно вирішити наступні завдання:

  • Розробити засоби для опрацювання наданої інформації
  • Визначити цікаві гени для дослідження
  • Розробити метод порівняння результатів
Після початкового перегляду даних на яких буде ґрунтуватися дослідження встановлено:
  • тексти містить велику кількість термінів складних для розуміння

Вимога на систему

Спонсор проекту (Project Sponsor)

  • Софія Кравчук

Бізнес потреба (Business Need)
  • Зробити доступною інформацію широкому колу людей.
  • Визначити цікаві гени для дослідження
  • Розробити метод порівняння результатів

Бізнес вимоги (Business Requirements)
  • Міститься вся інформація про генетичну інформацію різних організмів
  • Підтримується можливість пошуку по всій інформації.

Бізнес вигоди (користь) (Business Value)
  • Програма дозволить легко проводити аналіз та порівняння інформації про схожість та відмінність генотипу організмів різних видів організації
  • Зросте зручність і швидкість доступу до інформації.

Питання та обмеження (Special Issues or Constraints)
  • Робота повинна бути виконана до 12 травня 2019 р.

Опис функціональних можливостей API

API для роботи з даними відсутній.

⚠️ **GitHub.com Fallback** ⚠️