Полезное про MongoDB - rsajob/docs GitHub Wiki

В статье Атомарность и Lock в MongoDb рассказывается как сделать блокировку инкремента. Уловка заключается в том что js рбаотает в одном потоке, и при выполнении js функции всё остальное блокируется. Также расказывается о аналоге хранимых процедур, но надо быть осторожним с ними в mongoDB по той же причине что они блокируют процесс.

Полезно почитать статью Анализ логов в реальном времени про организацию системы мониторинга, основанной частично на MongoDB для хранения и работой с логами и применения Capped Collections.

Топик Как правильно ориганизовать комментарии при использовании Mongo DB? расскрывает тему где хранить автора комментов, в одном документе или в отдельной коллекции.

Статья на хабре про агрегацию: тут