基因组可视化（Genomic Visualization） - ricket-sjtu/bioinformatics GitHub Wiki

基因组可视化的工具很多，有超过50种基因组浏览器，那么，怎么去选择呢？一般来说，基于下列标准：

• 任务的类型
• 数据的类型与数据的规模
• 数据的隐私问题

高通量基因组浏览器

• 任务目的
  • 高通量测序数据，检查其中的突变
  • 大型的BAM文件，本地或远程存储
  • 本地桌面运行，保证数据隐私
• IGV （integrative gnome viewer）
• UCSC Genome Browser
• UCSC Cancer Genome Browser
• Galaxy Trackster
• Savant Genome Browser