MySQL slow_query_log の設定 - okashoi/isucon-cheat-sheet GitHub Wiki
/etc/my.cnf.d とかその辺に以下のファイルを追加。
99-additional.cnf
[mysqld]
slow_query_log=1
slow_query_log_file=/var/log/mariadb/slow.log
long_query_time=0.1
log_queries_not_using_indexes=ON
確認
mysql> show variables like '%slow%';