同義突变 - niomium/fukquaa GitHub Wiki
同義突变, 是指基因上的序列發生点突变, 但由于编码的产物protein的氨基酸序列没有变. 就好比calcium写成kalkium, hanpok写成hanpoc, jesus写成yesus, johan写成yohan, vanadium写成wanadium一样, 虽然拼写形式变了, 但是發音并没有变.
密码子表
此处, CUAG按照相对分子质量, 编码成四进制中的0123.
其中, 初始密码子是AUG, 对应的四进制为213, 也就是最初的胜(肽链)的第一个氨基酸是含有甲硫氨酸的, 但有可能会被之後过程去掉.
碱基 | 四进制 | 产物 |
---|---|---|
CCC | 000 | 脯氨酸P |
CCU | 001 | 脯氨酸P |
CCA | 002 | 脯氨酸P |
CCG | 003 | 脯氨酸P |
CUC | 010 | 亮氨酸L |
CUU | 011 | 亮氨酸L |
CUA | 012 | 亮氨酸L |
CUG | 013 | 亮氨酸L |
CAC | 020 | 组氨酸H |
CAU | 021 | 组氨酸H |
CAA | 022 | 穀氨酰胺Q |
CAG | 023 | 穀氨酰胺Q |
CGC | 030 | 精氨酸R |
CGU | 031 | 精氨酸R |
CGA | 032 | 精氨酸R |
CGG | 033 | 精氨酸R |
UCC | 100 | 丝氨酸S |
UCU | 101 | 丝氨酸S |
UCA | 102 | 丝氨酸S |
UCG | 103 | 丝氨酸S |
UUC | 110 | 苯丙氨酸F |
UUU | 111 | 苯丙氨酸F |
UUA | 112 | 亮氨酸L |
UUG | 113 | 亮氨酸L |
UAC | 120 | 酪氨酸Y |
UAU | 121 | 酪氨酸Y |
UAA | 122 | 止 |
UAG | 123 | 止 |
UGC | 130 | 半胱氨酸C |
UGU | 131 | 半胱氨酸C |
UGA | 132 | 止 |
UGG | 133 | 色氨酸W |
ACC | 200 | 苏氨酸T |
ACU | 201 | 苏氨酸T |
ACA | 202 | 苏氨酸T |
ACG | 203 | 苏氨酸T |
AUC | 210 | 异亮氨酸I |
AUU | 211 | 异亮氨酸I |
AUA | 212 | 异亮氨酸I |
AUG | 213 | 甲硫氨酸M |
AAC | 220 | 天冬酰胺N |
AAU | 221 | 天冬酰胺N |
AAA | 222 | 离氨酸K |
AAG | 223 | 离氨酸K |
AGC | 230 | 丝氨酸S |
AGU | 231 | 丝氨酸S |
AGA | 232 | 精氨酸R |
AGG | 233 | 精氨酸R |
GCC | 300 | 丙氨酸A |
GCU | 301 | 丙氨酸A |
GCA | 302 | 丙氨酸A |
GCG | 303 | 丙氨酸A |
GUC | 310 | 缬氨酸V |
GUU | 311 | 缬氨酸V |
GUA | 312 | 缬氨酸V |
GUG | 313 | 缬氨酸V |
GAC | 320 | 天冬氨酸D |
GAU | 321 | 天冬氨酸D |
GAA | 322 | 穀氨酸E |
GAG | 323 | 穀氨酸E |
GGC | 330 | 甘氨酸G |
GGU | 331 | 甘氨酸G |
GGA | 332 | 甘氨酸G |
GGG | 333 | 甘氨酸G |
简化版密码子表
碱基 | 四进制 | 产物 |
---|---|---|
CCX | 00? | 脯氨酸P |
CUX、UU大 | 01?、112、113 | 亮氨酸L |
CA小 | 020、021 | 组氨酸H |
CA大 | 022、023 | 穀氨酰胺Q |
CGX | 03? | 精氨酸R |
UCX | 10? | 丝氨酸S |
UU小 | 110、111 | 苯丙氨酸F |
UA小 | 120、121 | 酪氨酸Y |
UA大 | 122、123 | 止 |
UG小 | 130、131 | 半胱氨酸C |
UGA | 132 | 止 |
UGG | 133 | 色氨酸W |
ACX | 20? | 苏氨酸T |
AUC | 210 | 异亮氨酸I |
AUU | 211 | 异亮氨酸I |
AUA | 212 | 异亮氨酸I |
AUG | 213 | 甲硫氨酸M |
AA小 | 220、221 | 天冬酰胺N |
AA大 | 222、223 | 离氨酸K |
AG小 | 230、231 | 丝氨酸S |
AG大 | 232、233 | 精氨酸R |
GCX | 30? | 丙氨酸A |
GUX | 31? | 缬氨酸V |
GA小 | 320、321 | 天冬氨酸D |
GA大 | 322、323 | 穀氨酸E |
GGX | 33? | 甘氨酸G |
意義
同義突变可以说是生物为了对抗毒元素铅汞砷镉钡锑铍碲铊、二氧化钛、贵金属化合物等等有害物质对遗传物质的损害, 做出的一种利用冗馀编码对抗这个淖世的机制.
并且越是出现次数多的氨基酸, 其对应的密码子越多.
同義突变虽然不改变表达产物, 但是会影响表达遬率, 且大多数降低表达遬率.
同义突变会影响除了蛋白质序列外的很多生物学过程, 比如转录因子的识别, mRNA的剪接、折叠和降解, 还有蛋白质翻译的起始、效率与准确性等.
同義突变大多有害.
但是同義突变也可以为我所用, 比如在ABCC11基因(清爽基因)的基础上, 实施同義突变改造, 即使ABCC11变回狐臭基因, 也会由于表达能力的下降, 阻止狐臭的产生.