Errata - nibb-unix/gitc201905-unix GitHub Wiki

UNIX基本コマンド

P.12 ワイルドカード

誤) $ ls MG_mpos[1-3]*.fastq

正) $ ls MG_mpos_[1-3]*.fastq


P.29 リダイレクションの例・入力

誤) 結果をname_list というファイルに保存

正) 結果をfasta_list というファイルに保存


p.38 実習27 メタキャラクタ 手順 2

誤) $ cp ../ecoli.protein.fastq .

正) $ cp ../ecoli_protein.fastq .


p.43 実習30 SAMtoolsのインストール:コマンド実行部分

正)

$ cd ~/data/1_unix

$ mv ~/Downloads/samtools-1.9.tar.bz2 unixtest または cp ~/Downloads/samtools-1.9.tar.bz2 unixtest

$ cd unixtest

$ tar jxvf samtools-1.9.tar.bz2

$ cd samtools-1.9

R入門

P.78 Rによるデータ解析 plotによる散布図の作成

誤) tissue(cancer/normal)によって色づけする

正) tissue(tumor/nomal)によって色づけする

UNIXによるテキストファイル処理

P.136 FASTA形式ファイルの処理例

誤) ¥t(タブ記号)はcommand+vを押した後にタブキーで入力できます

正) ¥t(タブ記号)はcontrol+vを押した後にタブキーで入力できます