FAQ - nibb-gitc/gitc2021mar-rnaseq GitHub Wiki

R

作業ディレクトリの設定

メニューからその他→作業ディレクトリの変更(command+D)　でディレクトリ選択

またはsetwd("ディレクトリ名") で選択

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data以下のファイルを消してしまった、改変してしまった。復活したい。

（方法１）bias5の講師用のホームディレクトリにオリジナルデータがあります。講師用のホームは、/home/courset1 です。

例　IU/etec_1.fq を復活させる場合。

$ cp /home/courset1/data/IU/etec_1.fq ./

（方法２）フルのデータセットは以下からダウンロードできるのでそこから復活する。

• https://www.nibb.ac.jp/cproom/gitc/nibb_gitc_rnaseq_20210310.tar.gz

bias5環境にて

$ mkdir download
$ cd download
$ wget https://www.nibb.ac.jp/cproom/gitc/nibb_gitc_rnaseq_20210310.tar.gz
$ tar xzvf nibb_gitc_rnaseq_20210310.tar.gz

downloadディレクトリ以下にオリジナルのdataディレクトリが解凍されます。

（方法３）rsyncを使う。

rsyncは途中でコピーが止まった場合、再開(resume）できるのがメリット。

$ rsync -avH [email protected]:~/gitc/data ./