オンライン受講のための環境構築

今回のトレーニングコースはオンラインでの開催となります。受講生の皆さんは、以下ガイドにしたがって、事前にお手持ちのコンピュータで環境を構築しておいてください。

環境構築が終わりましたら connection test の手順に従い接続テストを行ってください。

受講用

• オンラインレクチャー・サポートのためのソフトウェアをお手持ちの端末にインストールしてください。

  • Zoom　

    • https://zoom.us/jp-jp/meetings.html
    • 講義はZoomで配信されます。
    • クライアント版を推奨いたします。
    • インストール・利用方法はこちら

  • Discord　

    • https://discord.com/download
    • 講義中でのマシントラブル、個別の質問などの対応に使用します。
    • クライアント版を推奨いたします。

ローカルPCにインストール

• コースで使う解析ソフトウェアをお手持ちの端末にインストールしてください。
  • IGV
    • http://software.broadinstitute.org/software/igv/
  • R　
    • https://www.r-project.org/
    • 追加のパッケージとして edgeR, dendextend, gplots が必要です。関連するパッケージも含めてインストールしてください。
  • ErmineJ
    • https://erminej.msl.ubc.ca/download/
    • 起動のためには別途 Java（Java8以上）をインストールする必要があります。
    • 環境構築及び起動確認の方法についてはこちらをご覧ください。
  • 表計算ソフトウェア（必須ではありません）
    • データの閲覧にのみ使用します。
    • Excel, OpenOffice Calc, Numbers など何を使用しても構いません。

リモートログイン・シェル環境の構築

• コースの実習では、基生研内の大型計算サーバ「生物情報解析システム」にログインしてUNIXを実行します。そのための環境をお手持ちの端末に準備ください。
  • VPN接続（Mac, Windows どちらも必須）
    • 基生研内の計算サーバにログインする前に、まず「VPN接続」と呼ばれる特別な接続を基生研に対して実行する必要があります。詳しいやり方は受講生の皆様にメールでご連絡いたします。
  • MacOS
    • OS標準の"ターミナル.app"を使用します。使用方法はこちら
  • Windows10
    • Windows Subsystem for Linux および Windows Terminal を使用します。使用方法はこちら

以上の構築が終わりましたら、connection test の手順に従って接続テストを行ってください