Contents

PCへの各種ソフトウェアセットアップ

• Macを購入した際にいろいろ入れたので備忘録的に
• Linuxマシンを導入した版も

RNAseq解析

• 今はWebツールが充実しているらしい、そっちの方が簡単そう？

OpenMMを用いた分子動力学計算

• 簡易的なMD計算の実行

分子系統解析

• 系統樹を描いた
• 祖先型配列の推定も

構造解析（Cryo-EMマップからのモデル精密化）関連

• 編集中

注意事項

• 筆者個人の研究目的で作成・使用したプログラムの利用手順やインストール方法等をまとめる目的で使用しています
• 参考にした書籍・ウェブサイトは各項目にて記載しています
• 筆者の動作環境にあわせて参考書籍・ウェブサイトのプログラムを修正したものもあります（そのまま使用させていただいたものもあります）