Библиотека CoreArray - lanit-tercom-school/analyzeme GitHub Wiki

CoreArray - библиотека, написанная на C/C++, обеспечивающая парсинг GDS(Genomic Data Structure) файлов. Она написана непосредственно автором формата GDS, наиболее полная его статья, описывающая GDS / CoreArray, находится по адресу:

https://digital.lib.washington.edu/researchworks/bitstream/handle/1773/23754/Zheng_washington_0250E_11826.pdf

CoreArray описывается автором, как быстрая и оптимизированная библиотека. Использование GDS / CoreArray будет ощутимо быстрее других форматов данных и соответствующих им парсерам.

Автором также написаны две обертки - GDSFormat (для C / C++), gdsfmt (R).

https://github.com/CoreArray/GDSFormat

https://github.com/zhengxwen/gdsfmt

Также у CoreArray есть небольшая документация:

http://corearray.sourceforge.net/lib/html/annotated.html