03_3_2024年3月のセットアップ - kytk/abis-web-2024 GitHub Wiki

2024年3月も2024年1月と同じリポジトリを使用します。以下で準備をお願いします。

【重要＆注意】今回のデータはダウンロードするサイズが約40GB、展開した後のサイズが約80GBとなります。CONNで解析を進めるとさらに容量を使いますので、ハードディスクの容量にご注意ください。

リポジトリのアップデート

• ターミナルを起動し、以下の実行をお願いします。

• git pull は何度もできますので、以前アップデートされた方も改めてされてください。

  cd ~/abis/abis-202401
  git pull
  

• 最新かどうかを以下で確認します。

  ./check_version_2024.sh
  

• その結果、2024年2月24日11時30分時点では、以下になります。

  Date:   Sat Feb 24 09:57:08 2024 +0900
  

• まず、上記のようになっているか（もしくは、それより新しい日時になっているか）を確認してください。

データの入手

• 以下でデータを入手します。

  ./get_data_202403.sh
  

• 次のメッセージが表示されます。

データのダウンロードを行います
【重 要】今回配布されるMRIデータは、
 本チュートリアルの実習目的に限って使用可能です
 データを他の目的で使用したり、配布したりしないで下さい（二次使用厳禁）
 同意していただいた方のみダウンロードできます
 同意しますか? 
yesまたはnoを入力してください

• ここで yes とタイプしてEnterを押してください。

• そうすると、データのダウンロードが始まります。

• 以下のデータがダウンロードされます。トータル 40GB弱 になります。このため、ポケットWi-Fiなどを使っている方は気をつけてください。

  • rsfmri-data01.tar.gz
  • rsfmri-data02.tar.gz
  • rsfmri-data03.tar.gz
  • rsfmri-data04.tar.gz
  • tfmri-data.tar.gz

• ダウンロードが終わった後に、rsfmriディレクトリとtfmriに展開されます。

テストスクリプトの実行

• テストスクリプトを実行します。

  ./test_202403.sh
  

• 以下のメッセージが表示されます。

データが正しくダウンロードされたか確認を行います
テストは数秒で終わります
出力される数値を確認してください
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rsfMRI: 6722
tfMRI: 152
rsfMRIは 6722, tfMRIは 152以上あるはずです
ない場合は Pumble で問い合わせてください
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• うまくいかない場合は、Pumbleに問い合わせていただけたらと思います。