python.webpy - k821209/pipelines GitHub Wiki

#!/usr/bin/python

import web  # 기본으로 불러와줘야한다. 
import kang

file_fa = 'Creinhardtii_281_v5.0.fa'
dicHD2seq = kang.Fasta2dic(file_fa)

### 원하는대로 변수를 만들던 뭘 만들던 정의해놓을 수 있다. 

urls = ('/', 'index') # 이 웹앱에 루트 (/) 로 접속하면 index라는 클레스로 가라. 안내자.

render = web.template.render('templates/') # 템플릿이라는 폴더에서 html찾아서 코딩된 내역을 쏴줘라. 

# 내가 원하는 어떤 함수든 다 넣어둘 수 있다. 
def get_chopped(strin):
    window = 50
    out_list = []
    for i in range(len(strin)/window+1):
        try:
            out_list.append(strin[(i)*50:(i+1)*50])
        except IndexError:
            out_list.append(strin[(i)*50:])
    return out_list


# 안내자가 루트로 들어오면 다음의 index로 안내한다.
class index:
    # form api, 이 폼은 html안에서 render함수에 의해서 html모양으로 알아서 인식된다. 
    form = web.form.Form(
                 web.form.Textbox('chromosome',web.form.notnull, description="Chromosome number"),
                 web.form.Textbox('left',web.form.notnull, description="Left postion"),
                 web.form.Textbox('right',web.form.notnull, description="Right postion"),
                 web.form.Button('Submit'),
                )
    # GET이라는것은 웹페이지가 열리고 바로 보이는 것, 읽기에 해당한다. 
    def GET(self):
        chromosome_list = set(dicHD2seq.keys())
        # form을 가져온다. 
        form = self.form()
        # render에 선언된 templates 폴더로 가서 index.html을 로딩, 이때 chromosome_list, form 이라는 변수들을 넘겨준다. 
        return render.index(chromosome_list,form)
    # POST는 사용자가 어떤 값을 넣어주면 웹서버가 어떻게든 반응하는 함수
    def POST(self):
        # 같이 form을 불러옴, 앞에서 GET에서 밀어넣은 form정보가 그대로 들어가는듯. 
        form = self.form()
        # 폼이 거지같으면 다시 받으라. 
        if not form.validates():
            return render.index(form)
        # 폼에서 받은 값들을 쉬운 변수로 일단 다 바꾸자
        chromosome = form.d.chromosome
        left = int(form.d.left)-1
        right = int(form.d.right)
        # 폼에서 받은 값들을 우리 db에서 불러오자
        seq = dicHD2seq[chromosome][left:right]
        seqs = get_chopped(seq)
        # showseq.html을 로딩, seqs, form 변수를 밀어준다. 
        return render.showseq(seqs, form)
# 앱이 실행되면 서버상주
if __name__ == "__main__":
    app = web.application(urls, globals())
    app.run()