Troubles - k821209/pipelines GitHub Wiki

mysql 설치할때 암호를 안물어보는 문제 생길때 (주로 도커에서 문제 발생)

# 그냥 mysql도커를 활용
$ docker run -v /data/k821209/:/data/ -d -p 3306:3306 -e MYSQL_ROOT_PASSWORD=7890uiop --name mysql_orthomcl mysql

window linux system에서 그래픽 화면쓰는 앱 실행하기

xming 설치
export DISPLAY=localhost:0.0
python main.py # 뭐든 걍 실행
됨

부족증상들

#cairo
apt-get install libcairo2-dev

tight_vnc 깔고는 vnc서버 안에서 탭키가 지랄 작업창이동될때

http://blog.zerosum42.com/2011/10/tech-fixing-tab-key-in-vnc.html

xfconf-query -c xfce4-keyboard-shortcuts -p /xfwm4/custom/'<'Super'>'Tab -r

centos 에서 openmpi 깔고 개소리뜰때

#mca: base: component_find 어쩌고 에러뜨면
export LD_PRELOAD=/openmpi_location/lib/libmpi.so
#open mpi location 은 which mpiexec 해서 나오는 bin 폴더 한칸 밑 lib로 가면된다.

trinity에서 새로운 fastq인식 못할때

https://github.com/fstrozzi/Fastool/issues/5

$ fastool --append /1 --to-fasta SRA_1.fastq > SRA_1_fixed.fastq
$ fastool --append /2 --to-fasta SRA_2.fastq > SRA_2_fixed.fastq

SSLeay.xs:163:25: fatal error: openssl/err.h: No such file or directory

$ apt-get install libssl-dev

원격 데스크탑에서 자격증명 에러가 날때

원격 데스크탑을 실행한다. mstsc
옵션을 누른뒤 서버주소와 아이디를 입력하고 다른이름으로 저장을 눌러 원격 데스크탑 파일을 만든다.
메모장과 같은 에디터로 해당 파일을 열고 마지막 줄에
enablecredsspsupport:i:0
를 추가한뒤 파일을 열어서 접속한다.
끝

cannot find -lgfortran

$ gfortran -print-file-name=libgfortran.so
/usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.4.7/libgfortran.so

copy the file wherever directory your tool looking for

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