lims安装指导 - geneseeq/data-migration GitHub Wiki
lims安装
说明：lims系统是war工程，所有安装部署比较简单，是一个典型的tomcat web工程部署。
本文提供手动部署和自动化部署
安装准备
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jdk1.6
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apache-tomcat7
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biolims-standard.war
jdk1.6的安装
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下载jdk-6u32-windows-x64.exe,然后傻瓜式安装
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系统属性中配置JAVA_HOME,JRE_HOME属性。
oracle数据库安装
- 以administrator用户安装oracle服务器类
参考文档：oracle数据库安装
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创建lims系统使用的用户名，需具备DBA权限
create user test identified by test default tablespace users; grant resource,connect,dba to test; -
oracle一切准备就绪后，导入历史数据
imp.exe test/[email protected]:1521/geneseeq file=E:\data\20161124.DMP full=y;
tomcat安装
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将下载的tomcat包解压
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设置环境变量
CATALINA_HOME=D:\biolims\apache-tomcat-7.0.29 -
然后设置vm内存，在catalina.bat中新增内容，具体位置是在 rem ----- Execute The Requested Command ---------------------------------------
echo Using CATALINA_BASE: "%CATALINA_BASE%" echo Using CATALINA_HOME: "%CATALINA_HOME%" echo Using CATALINA_TMPDIR: "%CATALINA_TMPDIR%"
前边新增 set JAVA_OPTS=%JAVA_OPTS% -server -XX:PermSize=512m -XX:MaxPermSize=1024m
lims war包部署
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将war包放到D:\biolims\apache-tomcat-7.0.29\webapps
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启动apache-tomcat7，自动解压D:\biolims\apache-tomcat-7.0.29\webapps目录下的biolims-standard.war文件。
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删除ROOT目录以及其他目录，更改biolims-standard-v2.0.1目录名称为ROOT,删除biolims-standard.war文件。
注意： 如果是迁移程序，把原biolims目录下所有文件都复制过来。
- 配置oracle数据库
（1）打开ROOT\WEB-INF\classes\system.properties文本文件。
（2）设置hibernate.jdbcUrl=jdbc:oracle:thin:@localhost:1521:ORCL
备注：设置hibernate.user=oracle用户名
设置hibernate.password=oracle密码
设置hibernate.default_schema= oracle用户名
如果有ip=，则将服务器IP地址写在后面。