marvin2025_A - filipsPL/CADD-PW GitHub Wiki

💡 Proszę przeczytać dokładnie poniższe instrukcje.

1. Pobieramy dokument - template do odpowiedzi
2. Sprawdzamy strukturę, która została nam przydzielona (w formacie SMILES)
3. Wypełniamy tabelę w nagłówku dokumentu odpowiedzi
4. Odpowiadamy na pytania.
5. Odpowiedzi wysyłamy na mój adres (do znalezienia tutaj)
6. Po wysłaniu odpowiedzi kasujemy z komputera wygenerowane pliki i dokumenty
7. Tip: Wykonanie zrzutu ekranu: Ctrl+PrtScr

Życzę powodzenia! 👍

Dla wskazanej cząsteczki proszę wyznaczyć:

1. Wartość parametru PSA (polar surface area 2D) i podać jego wartość
2. pKa wszystkich grup których to może dotyczyć (załączyć rysunek); dołączyć odpowiedni wykres udziału poszczególnych form w zależności od pH
3. Czy związek ma szansę wchłaniać się w jamie ustnej, żołądku, jelitach? Odpowiedź krótko uzasadnić (1-2 zdania).
4. Dla wartości pH typowych dla śliny, żołądka, jelita proszę policzyć logD w tych pH; podać wartości oraz załączyć odpowiednie wizualizacje

Dla wskazanej cząsteczki stwierdzono, iż pewne efekty niepożądane związane są z terminalną grupą aromatyczną. Na podstawie bazy bioizosterów proszę zaproponować zamianę tej grupy na inną, która nie spowoduje zwiększenia masy molowej ani logP.

• Proszę załączyć zrzut ekranu odpowiedniego wpisu w bazie danych
• Przewidywania potwierdzić obliczeniami w programie Marvin - proszę podać MW i logP oryginalnego i zmodyfikowanego związku.

(wygenerowano Google Gemini Nano Banana 2.5)