marvin2017_C - filipsPL/CADD-PW GitHub Wiki
Wstęp :: GRUPA C
- Odpowiedzi proszę wklejać do dokumentu Office, który po zakończonej pracy należy zapisać i wysłać na mój adres mailowy:
- Na pierwszej stronie proszę podać: imię, nazwisko, grupę oraz strukturę w formacie SMILES, dla której przeprowadzają państwo obliczenia.
- typowe wartości pH w różnych obszarach przewodu pokarmowego pokazane są na rysunku na dole strony; proszę przyjąć dolne wartości zakresów.
Życzę powodzenia! :+1:
Zadania
Dla cząsteczki, której SMILES są podane na liście obecności, proszę policzyć:
Zadanie 1
- pKa wszystkich grup których to może dotyczyć (załączyć rysunek); dołączyć odpowiedni wykres udziału poszczególnych form w zależności od pH
- Czy związek ma szansę wchłaniać się w jamie ustnej, żołądku, jelitach? Odpowiedź krótko uzasadnić.
- Dla wartości pH typowych dla śliny, żołądka, jelita proszę:
- Policzyć logP, logD (w tych pH); podać wartości oraz załączyć odpowiednie wizualizacje (dla logP i logD)
- Policzyć PSA (polar surface area 2D)
- Policzyć rozpuszczalność w wodzie:
- pokazać wykres zależności rozpuszczalności (w mg/ml!) od pH
- ile wynosi rozpuszczalność (mg/ml!) w pH śliny, żołądka, jelita?
Zadanie 2
- Wkleić zasymulowane widmo 1H NMR i 13C NMR
- Podać wartość momentu dipolowego. Załączyć odpowiedni rysunek pokazujący ten wektor.
(Za: Review of in vitro digestion models for rapid screening of emulsion-based systems, David Julian McClements and Yan Lia, Food Funct., 2010,1, 32-59)