• CRAN Mirrorの設定
• コンソールから
• RStudioのメニューバーから
• パッケージの更新
• CRAN Task View
• パッケージのアンインストール
• CRAN未登録、開発中のパッケージ
• link

Rを便利に使うためのおすすめパッケージ 生態学関連で使われる便利なRパッケージ

CRANミラーはR本体やパッケージのインストール先として指定するミラーサイトです。自分の環境に近い国内のミラーサイトをCRANミラーに指定することを推奨します。

• 筑波大学ミラー: http://cran.md.tsukuba.ac.jp
• 統計数理研究所ミラー: http://cran.ism.ac.jp
• 会津大学ミラー: ftp://ftp.u-aizu.ac.jp/pub/lang/R/CRAN/
• 東京大学ミラー: http://ftp.ecc.u-tokyo.ac.jp/CRAN/
• 兵庫教育大学ミラー: http://essrc.hyogo-u.ac.jp/cran/

• Windows: Packages -> Set CRAN mirror...
• Mac : 起動 -> デフォルトのCRANミラー

メニューバー -> Tools -> Global options -> Packages -> CRAN mirror

install.packages("パッケージ名", dependencies = T) 依存するパッケージも一緒にインストールする場合にdependencies=T

install.packages("hoge.tar.gz", repos = NULL, type = "source")

Tools -> Install Packages...でパッケージを検索してインストール。

R本体のバージョン更新に伴い、パッケージの更新が行われることがあります。古いパッケージは新しいバージョンのRに対応していないこともあるので、そういう場合にはパッケージの更新を試みてください。

update.packages(checkBuilt = T, ask = FALSE)

update.packages(ask = "graphics")

各分野の使用で便利な複数のパッケージをまとめているのがCRAN Task Viewです。

library(ctv)
install.views("hoge")

でパッケージのインストールを行います。

特別な場合を除き、必要ないと思いますが、パッケージをアンインストールするには

remove.packages("hoge")

CRANに未登録なものや開発中のパッケージはGitHub上で管理されることが多いです。そうしたパッケージをインストールする際はdevtoolsパッケージを使ってインストールを行います。

library(devtools)
devtools::install_github("user/repository")

• http://ropensci.org/related/