UniProt蛋白条目与证据

更新：2026-10-13；状态：可用；验证范围：官方文档核对；检索与批量下载练习未在本机执行。

蛋白数据库条目同时包含序列和注释证据，人工审阅状态不等于每项功能都已实验验证。

从什么字段开始读

先核对accession、物种、蛋白名称和序列版本，再看功能、亚细胞定位、结构域、交叉引用及证据。UniProtKB包含经过人工审阅的Swiss-Prot部分与尚未完整人工审阅的TrEMBL部分；审阅状态和蛋白存在证据是不同概念。

同一个基因可能有多个异构体；数据库中的canonical序列是代表形式，并不自动代表每个组织的主要形式。下载FASTA时明确是否包含异构体，以及使用的是全库还是特定物种的proteome。

一次条目阅读练习

在UniProtKB入口按已知基因和物种查一个条目，记录ID、审阅状态、序列长度和一项功能注释。展开其证据或引用，说明该信息来自实验、人工综合还是计算推断。再查看交叉引用，核对与Ensembl基因或转录本的对应。

本页尚未批量调用API。正式下载应记录数据库release、查询条件、是否包含异构体、校验值和映射失败记录；条目历史可以追溯序列与注释更新。

在分析中怎样使用

蛋白质组入门与实践需要明确参考蛋白库和共享肽段导致的protein group。BLAST本地检索实践使用蛋白参考时，也要说明库的范围与版本；一个最佳命中不能取代证据阅读。

深入：UniProt proteome说明、官方查询接口说明、基因标识符与同源基因。