DNBSEQ测序与滚环扩增 - SpiralKernel/bioinfo-wiki GitHub Wiki
DNBSEQ测序与滚环扩增
更新:2026-10-13;状态:可用;验证范围:官方平台资料与原始研究核对;原理及判读,未执行湿实验或平台测序。
DNBSEQ用环状模板产生DNA纳米球,纳米球制备与前序文库PCR应分别理解。
核心结构
相关路线以环状模板经滚环复制产生包含多份模板信息的DNA纳米球DNB,再在阵列上读出。RCA/RCR和常规PCR的模板利用方式不同,大量拷贝仍来自相应原始分子。
cPAS是相关读出体系名称,具体实现需看化学版本;不能把历史公司的全部读出方案和当前产品混为同一技术。
不宜简单叫全程PCR-free
DNB形成阶段不等于前序建库。输入文库可能经过PCR、靶向扩增或其他处理;纳米球阶段避免指数PCR,不能推导整个样本没有扩增偏差。
第三方文库转换涉及结构、索引和拆分兼容。支持一种布局不代表全部文库可直接互换。
数据和比较
常见交付可为单双端FASTQ,接头、命名、索引方向和质量处理仍需核对。相同格式不意味着不同平台误差与选择完全相同。
在可比输入和目标下比较覆盖、重复、错误及目标范围,不据宣传做统一排名。来源:MGI DNBSEQ。连接见第二代测序原理与平台比较、测序错误重复偏差与嵌合体。