选择扫描与中性替代解释

更新：2026-10-14；状态：可用；验证范围：原始研究和官方资料核对；方法说明，未运行完整专业分析流程。

不同扫描统计量检测不同模式，离群和显著都需与历史、结构及技术替代解释比较。

常见证据

π或多样性比值看局部变异，FST看群体相对分化，Tajima D比较成对差异与分离位点估计，iHS/XP-EHH利用相应单倍型延伸。它们对时间、频率和数据条件不同，不能用一种阈值统一判断。

Tajima D正负不是简单“正选择/负选择”：扩张、瓶颈、结构和不同选择类型均可能影响频谱。高FST也可能来自漂变或局部多样性变化。

必要检查

明确可检测区域、单态/缺失、样本数、祖先等位/分相需求、重组或距离、窗口与标准化。单倍型统计要按软件定义处理，不能将未分相矩阵直接冒充默认分相输入；支持的未分相模式需显式选择。祖先编码与标准化要求按统计量区分，见群体遗传软件与输入选择。

比较合理中性历史、匹配区域及多个证据，并记录多重比较。多个相关指标共同极端不等于完全独立验证；功能注释支持候选解释，不能确认因果。

本项目只在人工完整单倍型计算Tajima D，没有进行真实选择扫描或求其显著性。原始来源：Tajima 1989，实现入口：selscan。