第二代测序原理与平台比较

更新：2026-10-13；状态：可用；验证范围：官方平台资料与原始研究核对；原理及判读，未执行湿实验或平台测序。

二代常以大规模并行读出代表，平台差别在模板呈现、信号和读出方式。

共有思想与分类边界

二代常指大规模并行测序，一次读取大量模板位置。许多体系通过克隆扩增或纳米球增强信号；“必须桥式PCR”和“全部采用荧光”都不成立。

NGS有时泛指新一代高通量技术，范围可能包含长读长。判断实际数据需看平台、化学和read类型，而非缩写。

路线	典型信号/模板	理解重点
Illumina合成测序与簇信号	簇和循环光学读出	同步、索引、单双端
DNBSEQ测序与滚环扩增	DNA纳米球与相应读出	RCA与前序文库PCR分开
半导体测序与同聚物信号	掺入相关离子信号	非光学检测与同聚物推断

454焦磷酸和SOLiD连接测序是历史路线，不应当作无需核对供应状态的当前默认方案。平台商品与试剂会变，本页不提供固定通量或价格榜。

对下游的影响

短read可能难以跨越长重复或连接远距离单倍型；高准确率和通量也不消除文库偏差。双端是片段两端信息，不等于真正长读长。

选型结合目标、样本、覆盖、分子复杂度、资源和验证需求，见测序方案选型与实验设计。来源：Illumina技术、DNBSEQ、半导体原始研究。