测序质控工具选择与报告阅读

更新：2026-10-13；状态：可用；验证范围：官方平台资料与原始研究核对；原理及判读，未执行湿实验或平台测序。

按读段、长读长与组装层级选工具，报告汇总不等于自动修复问题。

工具在哪个阶段

工具	常见用途	不能推导什么
FastQC	read质量、接头、GC等	全部通过证明实验成功
fastp	FASTQ预处理和报告	默认剪切适合全部文库
MultiQC	汇总多工具、多样本报告	自动完成全部原始分析
NanoPlot	长read长度、质量、产量图	大N50保证组装正确
QUAST	组装长度和相应参考比较	无参考也能发现全部错组装
BUSCO	选定谱系保守基因完整性	全基因组结构和纯度正确

支持输入与能力随版本变，应核对实际版本。

阅读报告

先核对样本/文库，再看样本间异常、长度、质量和数量。扩增子或小RNA不必符合随机WGS图形，需结合设计解释GC、重复和组成。

保存处理前后数量，过度剪切可丢信息。有效覆盖还需比对和目标区域，原始QC不能给出全部下游质量。

本页未运行这些工具，仅提供选型与报告指南。人工区间贯通测序指标不是FastQC或fastp实测。

官方入口：FastQC、fastp、MultiQC、NanoPlot、QUAST、BUSCO。