测序方案选型与实验设计

更新：2026-10-13；状态：可用；验证范围：官方平台资料与原始研究核对；原理及判读，未执行湿实验或平台测序。

按问题、样本、信息结构和验证需求选技术，不用代数或单个宣传指标代替设计。

先明确需要看见什么

目标是少数区域、小变异、长重复、结构变异、转录本连接还是原生修饰？要发现、定量、组装还是验证？测量目标决定信息需求，不能先选平台再强套问题。

任务	可考虑路线	额外限制
少数目标确认	Sanger或适当靶向	混合模板、低比例信号、可判读范围
大量样本小变异/计数	合适短读长设计	参考、复杂区、重复、覆盖
重复跨越、分相、组装	合适长读长路线	完整性、准确性、覆盖、资源
RNA量或异构体	计数型或长读长RNA	捕获范围、链特异、全长比例
原生修饰	兼容原生分子/专门处理	建库保留信息、模型与验证

路线可以互补，不表示每项唯一指定平台。

样本与预算

检查样本完整性、独立重复及批次。增加深度改变测量信息，增加独立个体改变生物学推断，两者不互换。

统一建库、目标有效产量、分析/存储、失败重做与验证成本。型号、试剂、供应和报价变化，具体采购需重新核对，本页不列价格榜。

预定交付

明确样本表、文库/read布局、原始信号保留、有效数据口径、参考、质量报告、失败判定和分析范围。入口见测序技术与PCR学习路线，数量见测序产量有效数据与成本口径，验证见组学验证的层级与证据。

来源：Illumina单双端、PacBio HiFi、ONT。