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测序产量有效数据与成本口径

更新:2026-10-13;状态:可用;验证范围:官方平台资料与原始研究核对;原理及判读,未执行湿实验或平台测序。

分开计量读段数、碱基量、可用分子覆盖和交付成本,避免数量级混淆。

读段数与碱基量

100万对PE150的理论序列量为100万×2×150=3亿碱基,即0.3 Gb;Gb是10⁹碱基的数量口径,不是压缩文件GB。“100万reads”是否含两端必须确认。

原始产量、拆分后、过滤后碱基和有效比对产量不同。重复、双端重叠、低质量、污染和目标外区域使原始Gb不等于独立有效覆盖。

深度估算的边界

有效碱基量/目标长可粗估平均深度,仍依赖覆盖定义、去重和分布。均值不保证所有位点过门槛,见测序深度覆盖度与质量分数。

按分子合并重叠与直接加read碱基口径不同;扩增子高read深度也不能还原成同样多的原始模板。

成本比较

统一样本数、建库、目标可用产量、分析/存储、失败重做及验证范围。仪器最大通量或宣传每Gb价格不等于项目总费用。本页不列随时间和地区变化的报价。

技术选型见测序方案选型与实验设计,计算见人工区间贯通测序指标。定义依据:Illumina单双端。