方差分析交互作用与对比 - SpiralKernel/bioinfo-wiki GitHub Wiki
方差分析交互作用与对比
更新:2026-10-13;状态:可用;验证范围:教材、原始研究或官方文档核对;概念与方法说明。
多个组和多个因素应写成明确模型;总体检验、特定对比和交互作用回答不同问题。
ANOVA怎样比较均值
单因素经典ANOVA通过组间与组内均方比构造F统计量,检验所有组总体均值相等。其经典参考分布依赖独立观测、适当正态误差和同方差等条件;Welch ANOVA等变体具有不同设置。
拒绝总体零假设只说明至少存在一个差异,不告诉哪些组不同。分别对每两组做未经校正的t检验会引入额外错误,应明确预先指定对比或合适的多重比较方法。
多因素模型与交互作用
例如 y ~ treatment + sex + treatment:sex。主效应和交互作用的解释取决于编码;有交互时,某一个主效应系数不一定表示所有个体中的平均处理效果。
“男性组显著、女性组不显著”不能直接证明性别影响处理效应。应估计并检验两组处理效应之差,即相应交互或对比。
对比在比较什么
对比是系数的线性组合,如处理B相对A、两个处理均值相对对照。先写方向与权重,再对应设计矩阵。非平衡设计下不同平方和类型可能回答不同问题;不能仅比较输出表中的P值。
重复测量、多地点或供体嵌套需要相应误差结构,不应直接当普通独立ANOVA。进入线性模型与混合模型,并确认实验设计与统计功效。
本页为模型说明,未运行多因素组学ANOVA。接口与编码依据:SciPy单因素ANOVA、Bioconductor设计矩阵与对比教程。