文库接头索引与条形码

更新：2026-10-13；状态：可用；验证范围：官方平台资料与原始研究核对；原理及判读，未执行湿实验或平台测序。

文库是可进入测序的分子集合，接头、样本索引和UMI各有不同作用。

分子上可能有哪些组成

插入片段承载研究对象；接头提供平台所需结构；测序引物识别起始位置；样本索引用于拆分混合样本。UMI与细胞条形码另有分子或细胞识别用途，见UMI与细胞条形码。

标签可能位于独立index read或生物学读段中。不能看到R1就默认全部是目标序列，也不能把所有barcode叫UMI。

拆分为何需要样本表

demultiplexing依据索引映射拆回样本，依赖序列、方向、匹配规则和read布局。i5方向随平台与软件要求而异，应按实际说明确认，不能统一反向互补。

索引串样和样本污染不是同一种来源。独特双索引有助识别某些异常组合，但不能消除所有交叉污染。

交接记录

保存建库方式、接头结构、索引表、read布局、UMI位置、拆分软件/版本和未分配比例。结构决定剪切、去重与计数，不能凭文件后缀猜测。

下一步见从样本到FASTQ的交接与质控。依据：索引测序说明、独特双索引。