扩增子测序与靶向测序设计

更新：2026-10-13；状态：可用；验证范围：官方平台资料与原始研究核对；原理及判读，未执行湿实验或平台测序。

扩增子和捕获针对有限区域，但目标选择、扩增与未检出解释各有偏差。

两种思路

扩增子用引物扩增目标；捕获从文库富集与探针相关区域。覆盖、边界和偏差不同，不能因都叫panel就认为可互换。

先定义参考、目标区域、转录本/变异类型和分析范围。本页为设计判断，不给具体靶标引物和实验条件。

统计对象

read数、模板数和样本数不同。同起点常是扩增子设计所致，坐标去重不一定适用；UMI加入位置、识别和纠错决定能解决哪类重复。

引物结合变异、GC、效率和目标间竞争影响覆盖。目标未检出可能来自失败或检测范围，不自动等于生物学缺失。

交付与验证

保存目标BED/参考、布局、每目标覆盖、失败区域、分子/read统计和过滤规则。微生物扩增子还需区域、引物、分类库和污染对照，不同区域不直接等同。

确认见变异与群体分析的验证设计、微生物组差异与验证设计。参考：PacBio靶向分析、NHGRI PCR。