基因标识符与同源基因

更新：2026-10-14；状态：可用；验证范围：文档核对；操作需按所用环境验证。

基因符号、稳定标识符和跨物种同源关系表达不同信息，映射时必须记录来源与版本。

名称与标识符

基因符号方便阅读，但可能有别名、重名和历史变化。稳定标识符用于明确特征，版本后缀反映部分结构变化。删除版本后缀前，应保留原列并确认下游资源所需格式。

同源关系

ortholog 通常源于物种分化，paralog 源于基因复制。序列相似只能提供证据；最佳 BLAST 命中并不自动证明一对一同源关系，更不能直接推出相同功能。

映射检查

报告原始条目数、成功映射数、一对多、多对一和未映射条目。先定义如何处理重复，再进行富集分析与GSEA。禽类或其他非模式物种映射到人类基因时，应清楚区分物种自身注释与跨物种推断。

深入查看 Ensembl 稳定 ID 规则和 Ensembl 同源注释。

从ID映射到家族关系

同源正交旁系与基因家族解释为什么最高相似命中不能自动证明正交或相同功能。对于重复、亚基因组和一对多关系应保留多重映射，而非只留下第一条。

同一基因内多个转录本的选择见转录本选择与代表注释；完整关系表与报告表分别保留。