半导体测序与同聚物信号

更新：2026-10-13；状态：可用；验证范围：官方平台资料与原始研究核对；原理及判读，未执行湿实验或平台测序。

半导体测序检测掺入相关离子信号，连续相同碱基的数量由信号推断。

非光学路线

Ion Torrent相关体系在核苷酸掺入时检测氢离子相关变化并识别序列，说明二代不等于全部使用荧光相机。模板准备与芯片读取细节需看产品，本页不规定实验参数。

同聚物为何重要

同聚物是连续相同碱基，如一串A。一次相应信号需要反映加入多少相同碱基，长度推断受信号和模型影响，可表现为indel错误。

化学、芯片和算法改变实际误差，不能用早期论文错误率固定代表当前数据，也不能说其他平台没有同聚物问题。

下游判断

记录平台与basecaller，检查同聚物、上下文和indel证据。真实变异不能因“平台常见错误”全部删除，应结合质量、支持分子和独立验证。

选择见测序方案选型与实验设计。原始方法：Rothberg等半导体测序研究。