Old SOPs - LangilleLab/microbiome_helper GitHub Wiki

Amplicon sequencing data

• 16S Bacteria/Archaea SOP v1

• 18S Eukarya SOP v1

• ITS2 Fungi SOP v1

• 16S/18S/ITS SOP v1 Detailed Resources

• PacBio Amplicon SOP v1

• Amplicon SOP v2 (qiime2 2018.6)

• Amplicon SOP v2 (qiime2 2018.8)

• Amplicon SOP v2 (qiime2 2019.7)

• Amplicon SOP v2 (qiime2 2019.10)

• Amplicon SOP v2 (qiime2-2020.8)

Shotgun metagenomics sequencing data

• Metagenomics SOP v1