Modelling the immune system

CD4+ T cell Boolean Network

Martinez-Sánchez, M. E., Choreño-Parra, J. A., Álvarez-Buylla, E. R., Zúñiga, J., & Balderas-Martínez, Y. I. (2023). CD4+ T Cell Regulatory Network Underlies the Decrease in Th1 and the Increase in Anergic and Th17 Subsets in Severe COVID-19. Pathogens, 12(1), 18.

ZNF365 Drives Senescence of Experimental Lung Fibrosis

Urista, J., Maldonado, M., Toscano-Marquez, F., Ramírez, R., Balderas-Martínez, Y. I., Becerril, C., ... & Pardo, A. (2022). Lack of ZNF365 Drives Senescence and Exacerbates Experimental Lung Fibrosis. Cells, 11(18), 2848.

Induction of Hypoxia in IPF

Torres-Soria, A. K., Romero, Y., Balderas-Martínez, Y. I., Velázquez-Cruz, R., Torres-Espíndola, L. M., Camarena, A., ... & Aquino-Gálvez, A. (2022). Functional Repercussions of Hypoxia-Inducible Factor-2α in Idiopathic Pulmonary Fibrosis. Cells, 11(19), 2938.

Effect of Hypoxia in the Transcriptomic Profile

Romero, Y., Balderas-Martínez, Y. I., Vargas-Morales, M. A., Castillejos-López, M., Vázquez-Pérez, J. A., Calyeca, J., ... & Aquino-Gálvez, A. (2022). Effect of Hypoxia in the Transcriptomic Profile of Lung Fibroblasts from Idiopathic Pulmonary Fibrosis. Cells, 11(19), 3014.

Exposición a humo de cigarro y sobreexpresión de CCL2

Trejo, S. S. G., Pérez, D. M. M., & Balderas-Martínez, Y. I. (2022). La exposición al extracto del humo del cigarro induce la proliferación y la sobreexpresión de CCL2 en células A549, así como la migración de fibroblastos pulmonares. TIP Revista Especializada en Ciencias Químico-Biológicas, 25, 1-12.

Macrophage Boolean Network

Ordaz-Arias, M. A., Díaz-Alvarez, L., Zúñiga, J., Martinez-Sánchez, M. E., & Balderas-Martínez, Y. I. (2022). Cyclic Attractors Are Critical for Macrophage Differentiation, Heterogeneity, and Plasticity. Frontiers in molecular biosciences, 9.

Epistatic Network in Mycobacterium tuberculosis

Posada-Reyes, A. B., Balderas-Martínez, Y. I., Ávila-Ríos, S., Vinuesa, P., & Fonseca-Coronado, S. (2022). An epistatic network describes oppA and glgB as relevant genes for Mycobacterium tuberculosis. Frontiers in Molecular Biosciences, 9.