H.T.U RStudio - JiangLiNSCC/TH2-demos GitHub Wiki

天河二号RStudio使用简介

1. 登录ln节点，加载rstudio模块。

[user123@ln0%tianhe2-C ~]$ module load rstudio
#######################################
usage: rstudio-alloc
#######################################

2. 运行rstudio-alloc命令分配计算节点，并获得网址。

[user123@ln0%tianhe2-C ~]$ rstudio-alloc
[2017-03-01 14:39:06] requesting resources...
[2017-03-01 14:39:06] Submitted batch job 4718286
[2017-03-01 14:39:06] job not started yet, wait...
[2017-03-01 14:39:11] job started!
[2017-03-01 14:39:12] This job will run for *** 7 days ***
[2017-03-01 14:39:12] You can stop it anytime using command "scancel 4718286".
[2017-03-01 14:39:12] Visit your Rstudio session: http://172.16.22.11:8787/rstudio/cn12345/
[user123@ln0%tianhe2-C ~]$

3. 用浏览器打开上述网址，输入天河账号和密码登录。

login

4. 如需结束RStudio作业，请使用scancel命令。

[user123@ln0%tianhe2-C ~]$ scancel 4718286

注意事项：

  • RStudio 使用密码登录，首次使用前请先联系应用推广部（开通账号、分区的老师）进行设置。
  • Rstudio作业默认持续运行7天。关闭浏览器只是退出RStudio会话（ Session），作业并不因此结束，机时也在继续累计。用户必须使用scancel终止作业，以免浪费机时。
  • rstudio-alloc命令运行并获得网址后，该终端窗口可以关闭，并不影响浏览器的连接。
  • 浏览器中的连接因故断开后（如本地网络WIFI断开、电脑关闭等），只要重新打开网址即可恢复会话，无需重新运行rstudio-alloc命令。
  • 同一时间，一个账号只可连接一个RStudio会话。当有新浏览器打开Rstudio，原浏览器中的会话会被断开。
  • 想查看当前rstudio任务列表，可用命令squeue -p rstudio。
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