настройка mikrotik - AntonAndreevichMoroz/RealMikrotikBackup GitHub Wiki
Для сервера резервного копирования должен быть доступ по SSH
Для безопасности можно создать отдельную группу с минимальными правами, необходимыми для резервного копирования
/user group add name=forbackup policy=ssh,ftp,read,write,policy,test,sensitive,!local,!telnet,!reboot,!winbox,!password,!web,!sniff,!api,!romon
И создать отдельного пользователя, включив его в эту группу
/user add group=forbackup name=%UserName% password=%Password%