Instalación paso a paso

Instalar Miniconda3

Para poder instalar PICRUSt2 se requiere primero instalar conda, por lo que hay que descargar el archivo de miniconda que corresponda al sistema operativo (aqui) y en la ventana de la terminal correr lo siguiente:

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

Para comprobar que se haya instalado de manera exitosa correr el comando conda list

Instalar mamba

Los autores que desarrollaron PICRUSt2 recomiendan que se descargue mamba, debido a que esto disminuye el tiempo de instalación considerablemente (de horas/días a minutos)

conda install -n base --override-channels -c conda-forge mamba 'python_abi=*=*cp*'

Instalación PICRUSt2

Una vez que tengamos instalado conda y mamba podemos correr el siguiente comando

mamba create -n picrust2 -c bioconda -c conda-forge picrust2=2.5.2

Después de la instalación, necesitaremos activar el ambiente de conda y ya podremos empezar a trabajar con PICRUSt2

conda activate picrust2